การศึกษาลักษณะทางพันธุกรรมของ Omicron และรูปแบบการถ่ายทอดในช่วงต้น

ตัวแปร Omicron ของ SARS-CoV-2 แตกต่างจากสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ก่อนหน้าอันเป็นผลมาจากวิวัฒนาการแบบปรับตัว ซึ่งการกลายพันธุ์ที่เป็นประโยชน์จะถูกส่งต่อไปยังคนรุ่นต่อไปโดยการคัดเลือกโดยธรรมชาติ แทนที่จะผ่านการรวมตัวกันใหม่ระหว่างสายพันธุ์ก่อนหน้า ทีมนักวิจัยนานาชาติขนาดใหญ่ การศึกษาซึ่งตีพิมพ์เมื่อเร็ว ๆ นี้ใน Nature เป็นครั้งแรกที่อธิบายถึงโปรไฟล์จีโนมของ Omicron และสำรวจต้นกำเนิดของตัวแปร

Maciej Boni รองศาสตราจารย์ด้านชีววิทยากล่าวว่า “เราได้เห็น SARS-CoV-2 สร้างสามตัวแปรหลัก ได้แก่ Alpha, Delta และ Omicron – ในเวลาประมาณ 16 เดือนซึ่งน่าแปลกใจมากเพราะไวรัสอื่น ๆ ไม่ได้ทำให้เกิดการก้าวกระโดดครั้งใหญ่ซ้ำแล้วซ้ำอีก” Maciej Boni รองศาสตราจารย์ด้านชีววิทยากล่าว , Penn State ซึ่งเป็นผู้นำการวิเคราะห์การรวมตัวใหม่สำหรับความร่วมมือระดับโลกนี้ “ตัวแปรล่าสุด – Omicron – เป็นเรื่องพิเศษเนื่องจากการกระโดดที่ยิ่งใหญ่กว่าที่เกิดขึ้นในการวิวัฒนาการของโปรตีนขัดขวาง”

Boni ตั้งข้อสังเกตว่าเมื่อเทียบกับตัวแปรก่อนหน้านี้ โปรตีนขัดขวางของ Omicron มีการกลายพันธุ์มากกว่า 30 ครั้ง ซึ่งทราบกันดีอยู่แล้วว่ามีอิทธิพลต่อการวางตัวเป็นกลางของแอนติบอดีของโฮสต์

“จากการที่ Omicron ก้าวไปข้างหน้าอย่างก้าวกระโดดในด้านวิวัฒนาการ เราต้องการตรวจสอบว่าเหตุใดจึงเกิดเหตุการณ์เช่นนี้ขึ้นและเกิดขึ้นได้อย่างไร” เขากล่าว

ในการทำเช่นนั้น ทีมงานซึ่งนำโดยศูนย์การตอบสนองต่อการแพร่ระบาดและนวัตกรรมในแอฟริกาใต้ ได้วิเคราะห์ลำดับ Omicron ทั้งหมด 686 ลำดับที่มีอยู่ภายในวันที่ 7 ธันวาคม พ.ศ. 2564 พวกเขาพบว่า Omicron อยู่ในสายเลือด B.1.1 ซึ่ง รวมถึงตัวแปรอัลฟ่าด้วย ที่น่าสนใจคือ ทีมงานพบว่า Omicron มีความแตกต่างทางพันธุกรรมจาก Alpha เช่นเดียวกับตัวแปรอื่นๆ ที่น่าสนใจ

“สิ่งนี้หมายความว่าแม้ว่า Omicron จะอยู่ในเชื้อสายเดียวกันกับตัวแปรอัลฟ่า แต่ก็เปลี่ยนไปอย่างมากจนแทบจำไม่ได้ว่าเป็นลูกพี่ลูกน้องหรือหลานชายของตัวแปรอัลฟ่า” โบนีกล่าว “เมื่อลำดับจีโนมของ Omicron เป็นครั้งแรก เห็นได้ชัดว่าไวรัสนี้มีศักยภาพที่จะมีความแตกต่างทางฟีโนไทป์อย่างมากจากสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ก่อนหน้านี้ที่เราคุ้นเคย”

เพื่อตรวจสอบว่าตัวแปร Omicron เกิดขึ้นครั้งแรกเมื่อใด ทีมงานได้ใช้เทคนิคที่เรียกว่าการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการแบบเบย์ที่ปรับเทียบตามเวลา พวกเขาคาดว่าวันที่บรรพบุรุษร่วมกันล่าสุดของ Omicrons ทั้งหมดมีอยู่ในช่วงต้นเดือนตุลาคม พ.ศ. 2564

จากนั้น ทีมวิจัยได้ใช้การวิเคราะห์การคัดเลือกกับลำดับ 686 Omicron และพบหลักฐานการคัดเลือกโดยธรรมชาติในเชิงบวกในยีนจำนวนมาก เนื่องจากตัวแปรแยกจากเชื้อสาย B.1.1 อื่น “การค้นพบนี้นำไปสู่ข้อสรุปของเราว่าวิวัฒนาการแบบปรับตัวมีบทบาทสำคัญในการเกิดขึ้นและการก่อตั้ง Omicron ในช่วงต้น” โบนีกล่าว “การค้นพบนี้ชี้ให้เห็นว่า Omicron น่าจะเป็นผลมาจากกระบวนการวิวัฒนาการที่สร้างไวรัสที่สามารถแพร่เชื้อได้สูงซึ่งหลีกเลี่ยงการตอบสนองของแอนติบอดีของเราได้บางส่วน”

นอกจากนี้ การค้นพบยังตัดการรวมตัวกันของสายพันธุ์ก่อนหน้าในแหล่งกำเนิดของ Omicron

“เราไม่พบหลักฐานที่น่าเชื่อถือว่า Omicron เป็น recombinant ของสายพันธุ์ SARS-CoV-2 ก่อนหน้านี้” Boni กล่าว

ทีมงานพบว่าตัวอย่าง Omicron บางตัวอย่างมีหลักฐานที่อ่อนแอว่ามีการสืบทอดสารพันธุกรรมจากไวรัสเดลต้า แต่การวิเคราะห์ทางสถิติไม่สามารถแยกแยะโอกาสสุ่มหรือข้อผิดพลาดในการจัดลำดับเล็กน้อยซึ่งเป็นสาเหตุของสัญญาณการรวมตัวใหม่ที่น่าสงสัยนี้

“จากข้อมูลที่ผิดพลาดเมื่อเร็ว ๆ นี้ซึ่งบ่งชี้ว่าตัวแปร Omicron และ Delta ได้รวมตัวกันใหม่เพื่อสร้างตัวแปรพิเศษ ‘Deltacron’ สิ่งสำคัญคือต้องสังเกตว่าการรวมตัวกันใหม่ดังกล่าวเป็นไปได้จริง แต่ขณะนี้ยังไม่มีหลักฐานว่าสิ่งนี้เกิดขึ้น” Boni กล่าว . “นอกจากนี้ ถ้ามันเกิดขึ้น ก็ไม่สามารถบอกได้ว่าคุณสมบัติของไวรัสดังกล่าวจะเป็นอย่างไรในแง่ของความสามารถในการแพร่และ/หรือทำให้เกิดโรคร้ายแรง รวมถึงปัจจัยอื่นๆ”

เกี่ยวกับการแพร่กระจายของ Omicron ทีมงานได้ข้อสรุปว่าการหลีกเลี่ยงภูมิคุ้มกันบางส่วนน่าจะเป็นตัวขับเคลื่อนหลักของการแพร่กระจายอย่างรวดเร็วของ Omicron ในแอฟริกาใต้เนื่องจากสัดส่วนของประชากรแอฟริกาใต้ที่มีภูมิคุ้มกัน (ไม่ว่าจะจากการติดเชื้อ การฉีดวัคซีน หรือทั้งสองอย่าง) สูงกว่า 60% .

“ความคิดที่ว่า Omicron สามารถหลบเลี่ยงระบบภูมิคุ้มกันได้บางส่วนได้รับการสนับสนุนจากการค้นพบล่าสุดอื่น ๆ ที่แสดงความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของการติดเชื้อ SARS-CoV-2 ที่เกี่ยวข้องกับการเกิดขึ้นของ Omicron” Boni กล่าว “เราทราบด้วยว่าตอนนี้ปริมาณไวรัสของ Omicron นั้นสูงขึ้นในผู้ที่ติดเชื้อ ซึ่งทำให้อัตราการแพร่เชื้อสูงเช่นกัน”

Boni ตั้งข้อสังเกตว่าคลื่น Omicron ในปัจจุบันเป็นเครื่องเตือนใจชาวอเมริกันทุกคนให้รักษาการฉีดวัคซีน COVID-19 ของเราให้เป็นปัจจุบันมากที่สุด

“เราไม่สามารถทนต่ออีกปีปฏิทินด้วยการเสียชีวิตครึ่งล้านได้” เขากล่าว

อ้างอิง: Viana R, Moyo S, Amoako DG และอื่น ๆ การแพร่กระจายอย่างรวดเร็วของตัวแปร Omicron SARS-CoV-2 Omicron ในแอฟริกาใต้ตอนใต้ ธรรมชาติ. 2022:1-10. ดอย: 10.1038/s41586-022-04411-y

บทความนี้ได้รับการตีพิมพ์ซ้ำจากเอกสารต่อไปนี้ หมายเหตุ: อาจมีการแก้ไขเนื้อหาสำหรับความยาวและเนื้อหา สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม โปรดติดต่อแหล่งที่อ้างถึง

(Visited 1 times, 1 visits today)

Be the first to comment

Leave a comment

Your email address will not be published.


*